Jayme Arcoverde de Albuquerque Cavalcanti, Warwick Estevam Kerr e Raphael Ribeiro da Silva: os primeiros dirigentes da FAPESP
Jayme Arcoverde de Albuquerque Cavalcanti assumiu como Diretor Presidente. Ele foi professor de diretor da Faculdade Medicina da Universidade de São Paulo (USP) e participou dos Fundos Universitários de Pesquisa para a Defesa Nacional, criados para apoiar as ações do Brasil na Segunda Guerra Mundial. Atuou também na elaboração do documento Ciência e Pesquisa, destinado aos deputados da Constituinte Paulista de 1947, estando presente na solenidade da assinatura da lei de criação da FAPESP, em 1960.
Warwick Estevam Kerr, empossado como primeiro Diretor Científico, era engenheiro agrônomo, foi professor da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq) da USP e no campus de Rio Claro da então recém-criada Universidade Estadual Paulista (Unesp).
Raphael Ribeiro da Silva assumiu o cargo de diretor administrativo da FAPESP em 1962. Nascido em 1904 em Ribeirão Preto, interior paulista, Raphael Ribeiro da Silva (1904-1975) estudou na Faculdade de Direito da Universidade de São Paulo (USP). Ele concluiu o curso em 1928 e começou sua carreira profissional na Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo, na qual foi Presidente da Comissão de Compras, membro do Tribunal de Impostos e Taxas e Diretor Geral. Ele exerceu suas funções administrativas nos gabinetes de seis secretários da Fazenda.
Em setembro de 1962, com a saída de Ribeiro da Silva, Celso Antônio Bandeira de Mello, assume a função de Diretor administrativo. Bandeira de Mello formou-se em ciências jurídicas e sociais em 1959 na Pontifícia Universidade Católica de São Paulo (PUC-SP).
FAPESP compra sua primeira sede própria, na Avenida Paulista
A FAPESP começou a funcionar em 1962 na Reitoria da Universidade de São Paulo e em seguida ocupou duas salas do edifício de laboratórios da Faculdade de Medicina da USP. Neste mesmo ano, o governador Carvalho Pinto concedeu à nova instituição uma dotação de US$ 2,7 milhões para a formação de um patrimônio rentável.
Esse patrimônio permitiu à fundação adquirir a sua primeira sede própria, transferindo-se em agosto de 1962 para o 14º andar do Edifício Louis Pasteur, na Avenida Paulista, 352.